Prosím čekejte...
Nepřihlášený uživatel
iduzel: 52782
idvazba: 60776
šablona: api_html
čas: 16.4.2021 13:27:30
verze: 4827
uzivatel:
remoteAPIs: https://cis-web.vscht.cz/zaverecne-prace/pracoviste/
branch: trunk
Obnovit | RAW

Ústav organické chemie

Vypsané disertační práce

Calixarenové analogy obsahující pyridinová jádra

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Design a syntéza nových makrocyklických systémů na bázi calixarenových analogů, obsahujících pyridinová jádra v rámci skeletu. Studium jejich chemického chování, základních chemických transformací a konformačních preferencí. Využití výše připravených makrocyklických systémů pro design nových receptorů schopných komplexovat anionty popř. neutrální molekuly (např. fullereny).

Chirální fluorační činidla na bázi triptycenu nebo [2.2]paracyklofanu

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Iptyceny a cyklofany našly uplatnění jako molekulární stroje, v chemii polymerů, materiálové chemii či katalýze. Triptycen je charakteristický neobvyklou D3h symetrií a jeho deriváty mohou být chirální. Podobně jsou deriváty [2.2]paracyklofanu zajímavé díky své planární chiralitě. Cílem této práce je inkorporovat chirální triptyceny nebo [2.2]paracyklofany do molekul fluoračních činidel (derivátů imidazolu nebo hypervalentních sloučenin křemíku). Připravené sloučeniny budou využity pro studium chemo-, regio- a stereoselektivity v nukleofilních fluoracích.

Enantioselektivní katalýza kontrolovaná helikální chiralitou

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: RNDr. Ivo Starý, CSc.

Anotace

Cílem Ph.D. projektu je příprava nových helikálně chirálních ligandů a komplexů kovů pro využití v enantioselektivní katalýze. Pozornost bude soustředěna na asymetrickou syntézu N-heterocyklických karbenů, cyklických (alkyl)(amino)karbenů a metallacyklů odvozených od helicenů. Tyto chirální ligandy/komplexy kovů budou využity ve vybraných enantioselektivních reakcích katalyzovaných tranzitními kovy jako například cykloisomerizaci alkynů, metathesi olefinů a hydrogenaci.

Heterocyklické inhibitory vybraných protein kinas

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Budou navrhovány a syntetizovány modifikované heterocyklické sloučeniny, jako inhibitory vybraných protein kinas, které jsou relevantními cíly pro potenciální terapeutika nádorových a neurodegenerativních onemocnění. Bude využita kombinace racionálního designu, syntézy kombinatoriálních knihoven a optimalizace aktivních látek.

Heterogenní katalýza na organických polovodičích tvořených samoskladbou

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Katalytické procesy nám poskytují celou řadu látek denní spotřeby tím, že snižují energetickou bariéru reakce, jejímž produktem je daná požadovaná látka. Specifická podskupina katalýzy na polovodičích využívá nejčistšího zdroje energie – světla – a přeměňuje jej na volné nosiče náboje, které následně spouští katalytický proces. Cílem této práce je vytvoření fotokatalyzátorů na bázi organických polovodičů utvořených samoskladbou. Vývoj katalyzátoru de novo je velmi pracný a v průběhu vývoje je nutné řešit řadu obtíží jednu po druhé tak, jak se objevují. V této práci namísto toho bude využito principů kombinatoriální/dynamické chemie a řízené evoluce komplexních systémů k tomu, aby systém sám tyto nástrahy překonal pomocí samo-procesů (skladby, třídění, organizace). Charakteristiky katalyzátorů budou testovány na vybraných modelových reakcích a slibné struktury dále rozpracovávány v úzce zaměřených studiích.

Komplexace fullerenů pomocí vyšších calixarenů/thiacalixarenů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Cílem práce je studium možností přípravy a vlastností vyšších calixarenů (s pěti a více fenolickými jádry), které by mohly fungovat jako receptory pro komplexaci fullerenů. Cílem je dosáhnout selektivní komplexace fullerenů změnou základního skeletu calixarenu s využitím principů supramolekulární chemie. Připravené deriváty budou využity nejen jako receptory pro komplexaci fullerenů, ale také pro konstrukci složitějších supramolekulárních struktur (self-assembly).

Komplexní přístup ke strukturní analýze nových polycyklických diterpenů z termitů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Termiti jsou skupina hmyzu s nejbohatším repertoárem obranných chemikálií. Jsou známí zejména výrobou zhruba sta různých polycyklických diterpenů s variabilní topologií dvojných vazeb v kombinaci s různými okysličenými skupinami připojenými k bi-, tri- a tetracyklickým diterpenovým kostrám. Navzdory rozsáhlému hledání nových termitových diterpenů v posledních desetiletích zůstává velká část jejich strukturálního bohatství neobjevená. Navrhovaný PhD. projekt se zaměřuje na chemickou diverzitu polycyklických diterpenů v takzvané skupině druhů Subulitermes z Jižní Ameriky, ve které jsme nedávno odhalili nečekaný repertoár struktur diterpenů. Projekt se bude zabývat diterpenovou rozmanitostí jako nástrojem pro chemickou taxonomii na jedné straně a příležitostí k úplné identifikaci struktur nových a komplexních přírodních sloučenin na straně druhé. Prvním cílem bude charakterizovat jednotlivé druhy na základě kombinace charakteristických chemických profilů s mitochondriálními sekvencemi DNA, identifikovat nové druhy, rozlišovat kryptické druhy a nakonec budovat fylogenetické hypotézy o jejich vztazích. Znalosti o celkové rozmanitosti diterpenu poslouží jako základ pro druhý cíl projektu, který bude kombinovat tradiční analytický pracovní tok s moderními přístupy a výpočetními nástroji, aby plně charakterizoval molekulární struktury v maximu detekovaných diterpenů.

Kovalentní katalýza s flaviny

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Flaviny jsou přírodní sloučeniny, které působí jako kofaktory v redoxních enzymech. Mechanismy transformací zabezpečovaných flavoenzymy jsou známy již několik desetiletí. Nicméně nedávno byly popsány nové principy aktivace substrátu, které jsou převážně založeny na kovalentním navázání substrátu k flavinové skupině. Inspirováni těmito nově objevenými enzymatickými procesy budou navrženy nové umělé flavinové katalytické systémy pro použití v organické syntéze, zejména pro in-situ přepólování enolátů.

MOF a COF materiály pro aplikace v Li-iontových bateriích: příprava, struktura a iontová dynamika.

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Jiří Brus, Ph.D.

Anotace

Vývoj hybridních a plně elektrických zařízení zvyšuje poptávku po efektivních systémech pro generování a ukládání elektrické energie. Mřížkové materiály na bázi MOF a COF díky dobře definované porézní architektuře, která umožňuje skladování a reverzibilní ukládání Li-iontů, pak představují ideální systémy pro konstrukci elektrod či formulaci pokročilých elektrolytických systémů. Cílem tohoto PhD projektu je navrhnout a optimalizovat novou třídu těchto mřížkových materiálů modifikovaných metallakarboránovými sloučeninami a nalézt vhodnou polymerní matrici pro dosažení optimální flexibility a iontové vodivosti při absenci rozpouštědla. Práce na tomto projektu bude zahrnovat přípravu kompozitních materiálů a jejich strukturní a fyzikálně-chemickou charakterizaci.

Mechanochemické indikátory pro optickou spektroskopii

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní program: Chemie
Vedoucí práce: Ing. Martin Krupička, Ph.D.

Anotace

Mechanochemické indikátory jsou molekuly, jež mění spektrosopické vlastnosti v závislosti na aplikované mechanické síle. Cílem práce je syntéza a studium těchto indikátorů. Vhodné molekuly využívající známé chromofory a fluorofory budou navrženy a studovány pomocí kvantově-chemických metod. Vybrané molekuly budou syntetizovány a studovány pomocí spektroskopických metod jak za přítomnosti mechanické síly, tak bez ní. Výsledkem by měly být molekuly umožňující měření mechanické síly a teoretický model jejího působení.

Modifikované DNAzymy a DNA origami

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Budou navrhovány a syntetizovány modifikované deoxyribonukleosid trifosfáty nesoucí funkční skupiny nebo ligandy pro komplexace kovů a budou použity pro enzymovou syntézu modifikovaných oligunukleotidů, které budou dále využity v selekci nebo konstrukci funkčních DNAzymů nebo DNA origami.

Modulární syntéza silanových dendritických materiálů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Precizně vybudovaná molekulární architektura je důležitým předpokladem funkčnosti daného materiálu. Proto je v současnosti vývoj metod, které umožňují přípravu přesně definovaných makromolekulárních látek předmětem intenzivního zájmu. Tématem projektu bude aplikace principů modulární syntézy při přípravě nových dendritických materiálů s vlastnostmi vhodnými pro medicínské uplatnění (diagnostika, terapeutika, teranostika, systémy pro dopravu léčiv). Knihovna stavebních bloků, která je už v naší laboratoři k dispozici, bude dále rozšířena syntézou nových sloučenin popř. funkcionalizací již existujících. Následně budou z těchto modulů, pomocí vhodně navržených postupů, sestavovány nové dendritické multifunkční materiály s požadovanými vlastnostmi. V aplikačním uplatnění těchto materiálů budeme navazovat na dlouhodobou spolupráci s externími pracovišti. Součástí práce bude důkladná analýza produktů pomocí vhodných technik (NMR, HRMS, GPC atd.). Požadavky na uchazeče:
• VŠ vzdělání (Ing., Mgr.) v organické chemii, organické technologii;
• ochota experimentovat a učit se nové věci;
• schopnost týmové práce.

NMR krystalografie farmaceuticky aktivních látek

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Jiří Brus, Ph.D.

Anotace

Je naléhavá potřeba snižovat výpočetní náročnost při současném zvyšování spolehlivosti NMR krystalografie založené na předpovědích struktur polymorfních forem pevným látek. Cílem tohoto projektu je analyzovat prvky krystalové symetrie spolu s dalšími geometrickými parametry a využít těchto poznatků pro stanovení strukturních vazných podmínek (a)nebo omezení a jejich implementace v rámci stávající postupů NMR krystalografie. Taktéž se předpokládá databázové hledání podobností strukturních motivů zkoumaných na Oddělení NMR spektroskopie ÚMCH.

Nanoterapeutika založená na antimikrobiálních peptidech pro léčbu infekcí způsobených rezistentními bakteriemi

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie

Anotace

Práce bude zaměřena na studium biodegradovatelných polymerních nanomateriálů nesoucích antimikrobiální peptidy. Studované nanomateriály budou mít lineární, větvenou nebo hvězdicovitou strukturu složenou z hydrofilních nebo amfifilních kopolymerů, jejichž struktura bude obsahovat spojky reagující na vnější stimuly. Cílem práce bude vyvinout efektivní nanoterapeutikum pro léčbu infekcí způsobených rezistentními bakteriemi. V rámci práce bude studována biologická účinnost těchto polymerních nanomateriálů v závislosti na detailní struktuře celého systému. Student si v průběhu práce rozšíří znalosti v oblasti přípravy zmíněných nanomateriálů, v oblasti in vitro biochemického a biologického testování a navazující in vivo biologické charakterizace nanomateriálů. Znalost a zkušenosti uchazeče v organické a/nebo makromolekulární chemii jsou výhodou, a to společně s chutí učit se novým věcem v dalších oborech, např. biochemii. V rámci práce se předpokládá úzká spolupráce se spolupracujícími biologickými pracovišti v Čechách i v zahraničí.

Neplanární nekonvenční pi-elektronové systémy

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: RNDr. Irena Stará, CSc.

Anotace

Cílem Ph.D. projektu je vývoj syntetických přístupů ke komplexním π-elektronovým systémům, jakými jsou rozsáhlé aromáty. Pozornost bude věnována také syntéze jejich funkčních derivátů. U těchto unikátních molekul bude studováno jejich dynamické chování, chemická reaktivita, uspořádání v krystalu, 2D samoskladba, chiroptické (a jiné spektroskopické) vlastnosti stejně jako přenos náboje či spinu.

Nové deazapurinové nukleosidy a nukleotidy jako potenciální antivirotika a cytostatika

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Budou navrhovány a syntetizovány nové modifikované deazapurinové nukleosidy, nukleotidy a profarmaka jako nových inhibitorů polymeras a dalších enzymů nukleotidového metabolismu, popř. nových ligandů (agonistů či antagonistů) nukleotidových receptorů. Vybrané aktivní látky budou dále optimalizovány s cílem identifikace kandidátů na další preklinický vývoj potenciálních antivirotik či cytostatik.

Nové způsoby aktivace vazby C-O pro pokročilé cross-coupling reakce

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní program: Chemie

Anotace

Cross-coupling reakce jsou součástí moderní chemie. Během cross-coupling reakcí je výchozí látka, která obsahuje reakční centrum (např. aktivovaná C-O vazba), modifikována na produkt reakce účinkem vhodného činidla v přítomnosti katalyzátoru. Cílem práce je zvýšit atomovou ekonomii cross-coupling reakcí látek s aktivovanou C-O vazbou. Během projektu budou navrženy nové typy reakčních center reprezentovaných aktivovanou C-O vazbou. U těchto látek bude cross-coupling reakce vedena tak, aby selektivně vznikly dva snadno separovatelné produkty.

Nukleofilní fluorační činidla na bázi hypervalentních sloučenin křemíku

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Fluorované sloučeniny hrají nezastupitelnou roli ve farmaceutické chemii a agrochemii, přičemž je stále větší důraz kladen na enantiomerně čisté látky. Přestože nukleofilní fluorace je jednou za základních metod příprav fluorovaných sloučenin, asymetrická fluorace sp3 center a fluorace na aromatickém jádru stále zůstávají výzvou z pohledu chemo-, regio- a stereoselektivity. Cílem práce je v rámci společného mezinárodního projektu se slovinskými spolupracovníky syntéza a aplikace nových účinnějších a selektivnějších činidel na bázi hypervalentních sloučenin křemíku a fluorimidazolidinů. Asymetrické modifikace činidel s výhodou využijí nové chirální [2.2]paracyklofany a triptyceny. Pro studium připravených sloučenin budou vedle experimentální organické chemie aplikovány 19F a 29Si NMR spektroskopie, stejně jako výpočetní chemie.

Návrh a příprava inhibitorů purin-nukleosid fosforylázy – SAR studie

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Zlatko Janeba, Ph.D.

Anotace

Nedávno jsme připravili nový typ acyklických nukleosidfosfonátů, jež jsou účinnými inhibitory lidské purin-nukleosid fosforylázy (hPNP). Takové látky mohou být využity při léčbě T-buněčných leukémií. Pro výběr vhodného preklicnického kandidáta je potřeba připravit větší sérii derivátů a otestovat jejich biologické vlastnosti. Bude vyvinuta a optimalizována jejich syntéza.

Návrh a příprava nových fotopřepínačů odvozených od heteroarylazobenzenů a bis-azobenzenů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Zlatko Janeba, Ph.D.

Anotace

Nedávno jsme publikovali syntézu vhodně substituovaných 5-fenylazopyrimidinů (viz citace). Jejich fyzikálně-chemické vlastnosti byly studovány pomocí in situ NMR spektroskopie a optické spektroskopie. Cílem současného projektu bude syntéza nových molekulárních fotopřepínačů založených na kombinaci bis-azobenzenů a pyrimidinu (a jiných heterocyklů), zejména bis(pyrimidyldiazenyl)benzenů. Bude vyvinuta a optimalizována jejich syntéza a budou studovány jejich fyzikálně-chemické vlastnosti.

Návrh a příprava nových proléčiv acyklických nukleosidfosfonátů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Zlatko Janeba, Ph.D.

Anotace

Acyklické nukleosidfosfonáty tvoří významnou skupinu antivirotik. Fosfonátová skupina je při fyziologickém pH deprotonována a ANPs jsou příliš polární na to, aby efektivně pronikaly do buněk. Proléčiva odvozená od ANPs umožňují tento problém obejít. Cílem projektu bude návrh, syntéza a studium nových proléčiv ANPs.

Přístupy k totální syntéze pyrazinochinazolinových alkaloidů založených na fumichinazolinu a jejich analogů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Dr. habil. Ullrich Jahn

Anotace

V tomto projektu budou vyvinuty krátké, biosyntézou inspirované syntetické přístupy ke komplexním pyrazinochinazolinovým alkaloidům založeným na fumichinazolinu. Tyto modulární totální syntézy budou základem pro studium jejich biologických účinků v rámci spolupráce. Plánována je též příprava malé a úzce zaměřené knihovny analogů, která doplní syntetizované přírodní látky.

Přístupy k totální syntéze pyrazinochinazolinových alkaloidů založených na glyantrypinu a jejich analogů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Dr. habil. Ullrich Jahn

Anotace

V tomto projektu budou vyvinuty krátké, biosyntézou inspirované syntetické přístupy ke komplexním pyrazinochinazolinovým alkaloidům založeným na glyantrypinu. Tyto modulární totální syntézy budou základem pro studium jejich biologických účinků v rámci spolupráce. Plánována je též příprava malé a úzce zaměřené knihovny analogů, která doplní syntetizované přírodní látky.

Racionální návrh flavinových fotokatalyzátorů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry

Anotace

Fotokatalýza viditelným světlem je v popředí zájmu, protože umožňuje nové chemické transformace, které jsou nedosažitelné konvenčními metodikami. Jednou z nejslibnějších tříd organických fotokatalyzátorů jsou flaviny odvozené od významných přírodních chromoforů, jako jsou FMN a FAD. Obecné trendy ve fotofyzikálních a elektrochemických vlastnostech budou studovány v řadě flavinových derivátů s cílem stanovit obecné přístupy k navrhování účinných, udržitelných a stabilních flavinových katalyzátorů pro aplikace ve fotoredoxních reakcích, jako jsou C-H aktivace a fotoredukce.

Rovnováha a kinetika v mechanochemických procesech

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní program: Chemie
Vedoucí práce: Ing. Martin Krupička, Ph.D.

Anotace

Syntetická organická mechanochemie se zabývá studiem reakcí vyvolaných mechanickou silou při mletí v kulovém mlýnu. Experimentální podmínky jsou výrazně odlišné od běžných reakcí v rozpouštědle. Díky tomu je možné studovat chemické děje z hlediska rovnováhy i kinetiky za extrémních podmínek. Cílem práce je aplikace mechanochemických postupů na organické reakce a optimalizace reakčních podmínek.

Sacharidové ligandy pro cílení lektinových receptorů

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní program: Chemie
Vedoucí práce: Ing. Petra Ménová, Ph.D.

Anotace

Savčí sacharidové receptory (lektiny) se účastní řady životně důležitých procesů, včetně rozpoznání, internalizace a zpracování patogenního materiálu, buněčné komunikace a buněčné migrace. Cílené dopravení terapeutických nukleových kyselin do hepatocytů má velký potenciál v léčbě hepatitidy B a prevenci hepatocelulárního karcinomu. Asialoglykoproteinový receptor (ASGPR) je téměř výhradně přítomen na povrchu hepatocytů, což ho činí ideálním kandidátem pro terapii cílenou na hepatocyty. DC-SIGN je lektinový receptor nacházející se na povrchu imunitních buněk, zejména dendritických buněk a makrofágů. Rozpoznává patogeny prostřednictvím vazby se sacharidy v jejich glykokalyxu. Tato interakce spouští imunitní odpověď, ale některými patogeny je zneužívána pro usnadnění jejich šíření v hostitelském organismu. Selektivní blokace této interakce by tak měla vést k prevenci některých chorob, například, HIV nebo hepatitidy C. Cílem této disertační práce je syntetizovat ligandy specifické pro ASGPR a DC-SIGN receptory. Ligandy ASGPR receptoru budou navázány na lipidické nanočástice a využity k cílenému transportu CRISPR/Cas9 systému do hepatocytů. DC-SIGN ligandy budou použity pro studium interakcí ligand–protein.

Syntéza a použití N-fluoroalkylovaných sloučenin

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Petr Beier, Ph.D.

Anotace

Naše nedávno publikovaná syntéza perfluoralkyl azidů a triazolů1 otevřela nové možnosti ke studiu vlastností a reaktivity těchto látek. V tomto projektu budou studovány nové syntetické přístupy k obecně málo probádaným N-perfluoralkylovaným sloučeninám1-10 jako jsou azidy, azoly, aziriny, močoviny, karbamáty a amidy. Očekává se, že tato skupina látek najde použití ve vývoji nových léčiv a materiálů

Syntéza cytochalasanových analogů s antimetastatickou aktivitou

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Léčiva a biomateriály

Anotace

Cytochalasany jsou přírodní látky se zajímavými biologickými aktivitami. Typická je pro cytochalasany vazba na rostoucí konce aktinových mikrofilament. Díky následnému ovlivnění dynamiky mikrofilament byla u některých zástupců přírodních cytochalasanů pozorována aktivita proti metastázování nádorových buněk. Antimetastatická aktivita je klíčovou vlastností tzv. migrastatik, nové třídy potenciálních protinádorových léčiv. V rámci dizertační práce budou navrženy a připraveny nové analogy cytochalasanů na základě racionálního designu a bude provedena studie závislosti aktivity na struktuře. Dále bude práce zaměřena na vývoj a přípravu cytochalasanových proléčiv, které budou lépe rozpustné ve vodě.

Syntéza ligandů pro C-lektinové receptory

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní program: Chemie
Vedoucí práce: Ing. Petra Ménová, Ph.D.

Anotace

Savčí sacharidové receptory (lektiny) se účastní řady životně důležitých procesů, včetně rozpoznání, internalizace a zpracování patogenního materiálu, buněčné komunikace a buněčné migrace.
DC-SIGN je C-lektinový receptor nacházející se na povrchu imunitních buněk, zejména dendritických buněk a makrofágů. Rozpoznává patogeny prostřednictvím vazby se sacharidy v jejich glykokalyxu. Tato interakce spouští imunitní odpověď, ale některými patogeny je zneužívána pro usnadnění jejich šíření v hostitelském organismu. Selektivní blokace této interakce by tak měla vést k prevenci některých chorob, například HIV nebo hepatitidy C.
Cílem této disertační práce je syntetizovat ligandy specifické pro DC-SIGN receptor, založené na derivátech D-mannosy a L-fukosy. Syntetizované ligandy budou studovány z pohledu selektivity vůči C-lektinovým receptorům a budou využity ke studiu interakcí ligand–protein.

Systémy založené na BODIPY určené pro uvolňování signálních molekul a modulaci biomolekulární aktivity

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Mgr. Tomáš Slanina, Ph.D.

Anotace

Hlavními cíli disertační práce jsou design, syntéza, spektroskopická charakterizace, vývoj a prověřování možných aplikací nové třídy fotoodstupitelných skupin[1] a fotoaktivovatelných chránících systémů[2] založených na BODIPY. Hlavní důraz bude kladen na systémy absorbující červené světlo, které mohou být aktivovány v biologickém okně[3]. Neobvyklé odstupující skupiny, jako jsou thiosulfonáty, xantháty, hydroxylaminy, (thio)semicarbazony atd. budou připojeny na jádro BODIPY s cílem vytvořit systémy uvolňující signální molekuly. Modifikací molekul budou také připraveny biokompatibilní linkery, které budou využity pro světlem kontrolovanou modulaci biomolekulární aktivity v optogenetickém přístupu. Kandidát/ka provede syntézu a charakterizaci organických fotoaktivovatelných molekul a bude studovat jejich chemické, fotofyzikální a fotochemické vlastnosti. Stane se členem/členkou dynamického juniorského výzkumného týmu vyvíjejícího malé organické molekuly podléhající redoxním procesům, fotoaktivovatelné molekuly a reversibilní chemické reakce. Vysoce motivovaný/á a zručný/á kandidát/ka bude mít příležitost rozšířit si postgraduální výcvik v oboru fyzikální a organické chemie o elektrochemické, fotochemické a pokročilé spektroskopické metody.

Vývoj a využití bioortogonálních štěpných reakcí zaměřených na buněčné organely

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Milan Vrábel, Ph.D.

Anotace

Chemické reakce, které lze provádět za fyziologických podmínek, nabízejí jedinečnou možnost manipulovat a studovat biologické procesy. Naše skupina má dlouhodobý zájem o tyto tzv. bioorthogonální reakce. Tyto reakce jsou známé hlavně jako účinné chemické transformace vedoucí k tvorbě kovalentních vazeb. Teprve nedávno byl koncept rozšířen na něco, co je známé jako bioorthogonální štěpné reakce. V tomto projektu se snažíme vyvinout a použít uvolňovací reakce, které umožní uvolňování malých molekul ve specifických buněčných organelách. Věříme, že takové systémy nabídnou nejen jedinečnou možnost dodávat a aktivovat funkční molekuly na konkrétním místě v buňce, ale v širším smyslu osvětlit funkci jednotlivých buněčných organel. Tento projekt zahrnuje práci na poli organické chemie a moderní chemické biologie.

Vývoj nových chemických nástrojů pro studium mezibuněčných interakcí

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie, Fakulta chemické technologie
Studijní programy: Chemie, Chemistry
Vedoucí práce: Ing. Milan Vrábel, Ph.D.

Anotace

Mezibuněčné interakce hrají důležitou roli v nesčetných biologických procesech. Tyto interakce umožňují buňkám komunikovat, reagovat na změny v prostředí a hrají důležitou roli při různých onemocněních včetně rakoviny. Navzdory jejich důležitosti je naše schopnost studovat molekulární detaily a povahu těchto interakcí stále velmi omezená. V tomto projektu plánujeme využít chemické glyko-inženýrství v kombinaci s biokompatibilními chemickými reakcemi k zachycení, identifikaci a studiu biomolekul zapojených do těchto interakcí. Tento projekt si klade za cíl objasnit složitost interakcí mezi buňkami a osvětlit jednotlivé proteiny zapojené do tohoto procesu. Ideální kandidát by měl mít zájem o organickou chemii, chemickou biologii a příbuzné obory.


VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích
zobrazit plnou verzi