stdClass Object
(
[nazev] => Doktorské studium na VŠCHT Praha
[adresa_url] =>
[api_hash] =>
[seo_desc] =>
[jazyk] =>
[jednojazycny] =>
[barva] => modra
[indexace] => 1
[obrazek] => 0001~~Cwt29gjRTcsv0vV3BwA.jpg
[ga_force] =>
[cookie_force] => 1
[secureredirect] =>
[google_verification] => UOa3DCAUaJJ2C3MuUhI9eR1T9ZNzenZfHPQN4wupOE8
[ga_account] =>
[ga_domain] =>
[ga4_account] => G-VKDBFLKL51
[gtm_id] =>
[gt_code] =>
[kontrola_pred] =>
[omezeni] =>
[pozadi1] =>
[pozadi2] =>
[pozadi3] =>
[pozadi4] =>
[pozadi5] =>
[robots] =>
[htmlheaders] =>
[newurl_domain] => 'phd.vscht.cz'
[newurl_jazyk] => 'cs'
[newurl_akce] => '[cs]'
[newurl_iduzel] =>
[newurl_path] => 1/50375/50376
[newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
[iduzel] => 50376
[platne_od] => 10.04.2024 23:55:00
[zmeneno_cas] => 10.04.2024 23:55:14.959919
[zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
[canonical_url] =>
[idvazba] => 57266
[cms_time] => 1715168427
[skupina_www] => Array
(
)
[slovnik] => stdClass Object
(
[preloader] => Prosím čekejte...
[logo_href] => https://www.vscht.cz/
[logo] => 
[logo_mobile_href] => https://www.vscht.cz/
[logo_mobile] => 
[google_search] => 001523547858480163194:u-cbn29rzve
[social_in_odkaz] => https://www.instagram.com/vschtpraha
[social_fb_odkaz] => https://www.facebook.com/vscht
[social_tw_odkaz] => https://twitter.com/vscht
[social_yt_odkaz] => https://www.youtube.com/user/VSCHTPraha
[intranet_odkaz] => https://intranet.vscht.cz/
[intranet_text] => Intranet
[mobile_over_nadpis_menu] => Menu
[mobile_over_nadpis_search] => Hledání
[mobile_over_nadpis_jazyky] => Jazyky
[mobile_over_nadpis_login] => Přihlášení
[menu_home] => Domovská stránka
[paticka_mapa_odkaz] => http://www.vscht.cz/kontakt
[paticka_budova_a_nadpis] => BUDOVA A
[paticka_budova_a_popis] => Rektorát, oddělení komunikace, pedagogické oddělení, děkanát FCHT, centrum informačních služeb
[paticka_budova_b_nadpis] => BUDOVA B
[paticka_budova_b_popis] => Věda a výzkum, děkanát FTOP, děkanát FPBT, děkanát FCHI, výpočetní centrum, zahraniční oddělení, kvestor
[paticka_budova_c_nadpis] => BUDOVA C
[paticka_budova_c_popis] => Dětský koutek Zkumavka, praktický lékař, katedra ekonomiky a managementu, ústav matematiky
[paticka_budova_1_nadpis] => NÁRODNÍ TECHNICKÁ KNIHOVNA
[paticka_budova_1_popis] =>
[paticka_budova_2_nadpis] => STUDENTSKÁ KAVÁRNA CARBON
[paticka_budova_2_popis] =>
[paticka_adresa] => VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČ: 60461373
DIČ: CZ60461373
Datová schránka: sp4j9ch
Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum
VŠCHT Praha
na sociálních sítích
[paticka_odkaz_mail] => mailto:Veronika.Popova@vscht.cz
[zobraz_desktop_verzi] => zobrazit plnou verzi
[drobecky] => Nacházíte se: VŠCHT → Web PhD
[more_info] => více informací
[aktualizovano] => Aktualizováno
[autor] => Autor
[social_in_title] =>
[social_fb_title] =>
[social_tw_title] =>
[social_yt_title] =>
[dokumenty_kod] =>
[dokumenty_nazev] =>
[dokumenty_platne_od] =>
[dokumenty_platne_do] =>
[stahnout] =>
[nepodporovany_prohlizec] =>
[hledani_nadpis] => hledání
[hledani_nenalezeno] => Nenalezeno...
[hledani_vyhledat_google] => vyhledat pomocí Google
[zobraz_mobilni_verzi] =>
[den_kratky_5] =>
[archiv_novinek] =>
[novinky_servis_archiv_rok] =>
[novinky_kategorie_1] =>
[novinky_kategorie_2] =>
[novinky_kategorie_3] =>
[novinky_kategorie_4] =>
[novinky_kategorie_5] =>
[novinky_archiv_url] =>
[novinky_servis_nadpis] =>
[novinky_dalsi] =>
[den_kratky_6] =>
[den_kratky_0] =>
[social_li_odkaz] =>
[den_kratky_1] =>
[cookie-policy-title] => Nastavení cookies
[cookie-policy-info] => Vážíme si vašeho soukromí
Tyto webové stránky ukládají do vašeho prohlížeče soubory cookie, které jsou nezbytné ke správnému fungování tohoto webu (nezbytně nutné). S vaším souhlasem bude web používat i další soubory cookie pro účely anonymní analýzy návštěvnosti webu (analytické) a pro personifikaci reklamy (marketingové). Souhlas můžete kdykoliv odvolat nebo upravit otevřením nabídky „Nastavení cookies“ v dolní části webové stránky. Souhlas poskytujete VŠCHT Praha pro doménu vscht.cz včetně domén 3. řádu. Další informace najdete na stránkách Zásady ochrany osobních údajů a Zásady práce s cookies.
[cookie-policy-necessary] => Nezbytně nutné
[cookie-policy-necessary-text] => Tyto soubory cookie jsou nezbytné, aby webové stránky správně fungovaly, proto je nelze vypnout.
[cookie-policy-analytics] => Analytické
[cookie-policy-analytics-text] => K anonymní analýze návštěv a používání webových stránek používáme cookies pro webovou analýzu.
[cookie-policy-functional] => Funkční
[cookie-policy-functional-text] => Tyto soubory cookie umožňují webové stránce zapamatovat si váš jazyk a volby, které uděláte. Doporučujeme potvrdit, aby pro vás bylo používání webu příjemnější.
[cookie-policy-button-accept-all] => Přijmout všechny
[cookie-choose-handler] => Vlastní nastavení
[cookie-choose-handler-send] => Uložit vlastní nastavení
[cookie-reject-all-handler] => Přijmout pouze nezbytné
[cookie-policy-button-customize] => Nastavení cookies
[cookie-policy-marketing] => Marketingové
[cookie-policy-marketing-text] => Tyto soubory cookie jsou používány k vyhodnocování reklamních kampaní a personalizaci reklam.
[kalendar_nadpis] => Události pro doktorandy
[cely_kalendar] => Celý kalendář
[zobrazit_kalendar] =>
[zobrazit_vice_kalendar] =>
)
[poduzel] => stdClass Object
(
[50378] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[poduzel] => stdClass Object
(
[50380] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 50380
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[50381] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 50381
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[50379] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[iduzel] => 50379
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
)
[iduzel] => 50378
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] =>
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] =>
)
)
[51163] => stdClass Object
(
[obsah] =>
[poduzel] => stdClass Object
(
[51164] => stdClass Object
(
[nazev] => Doktorské studium na VŠCHT Praha
[seo_title] => Doktorské studium na VŠCHT Praha
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] =>
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 51164
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /home
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => boxy
[html] =>
[css] =>
[js] => $(function() {
setInterval(function () { $('*[data-countdown]').each(function() { CountDownIt('#'+$(this).attr("id")); }); },1000);
setInterval(function () { $('.homebox_slider:not(.stop)').each(function () { slide($(this),true); }); },5000);
});
function CountDownIt(selector) {
var el=$(selector);foo = new Date;
var unixtime = el.attr('data-countdown')*1-parseInt(foo.getTime() / 1000); if(unixtime<0) unixtime=0;
var dnu = 1*parseInt(unixtime / (3600*24)); unixtime=unixtime-(dnu*(3600*24));
var hodin = 1*parseInt(unixtime / (3600)); unixtime=unixtime-(hodin*(3600));
var minut = 1*parseInt(unixtime / (60)); unixtime=unixtime-(minut*(60));
if(unixtime<10) {unixtime='0'+unixtime;}
if(dnu<10) {unixtime='0'+dnu;}
if(hodin<10) {unixtime='0'+hodin;}
if(minut<10) {unixtime='0'+minut;}
el.html(dnu+':'+hodin+':'+minut+':'+unixtime);
}
function slide(el,vlevo) {
if(el.length<1) return false; var leva=el.find('.content').position().left; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1;
var cislo=leva/sirka*-1; if(vlevo) { if(cislo+1>pocet) cislo=0; else cislo++; } else { if(cislo==0) cislo=pocet-1; else cislo--; }
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
function slideTo(el,cislo) {
if(el.length<1) return false; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; if(cislo<0 || cislo>pocet) return false;
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
[autonomni] => 1
)
)
[75736] => stdClass Object
(
[nazev] => Onboarding
[seo_title] => Onboarding
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] => Co je to onboarding?
Onboarding představuje klíčový adaptační proces pro nové zaměstnance, který jim umožňuje získat nezbytné znalosti, dovednosti a informace. Tento proces usnadňuje integraci nových členů do organizace a týmu a je přínosný zejména pro ty, kteří nastupují do společnosti poprvé. Rychlé a efektivní začlenění do pracovního prostředí hraje klíčovou roli v tom, jak brzy nový zaměstnanec dosáhne úspěchu ve své práci.
V kontextu soukromého sektoru je onboarding běžný, avšak v akademických institucích je často opomíjen. Toto platí zejména pro nové mladé výzkumníky (ECR), konkrétně doktorandy. Kvalitní onboardingové postupy mají vliv na jejich začlenění do organizace, na pochopení rolí a odpovědností v rámci jejich programu či na pohodu a schopnost úspěšně plnit své pracovní úkoly. Tato podpora je klíčová právě zejména v případě ECR v akademickém prostředí, kde nedostatečná podpora a nejistota mohou vést obzvláště na začátku doktorátu k pochybnostem, a dokonce i k předčasnému opuštění výzkumného projektu. Úspěšný onboarding významně přispívá k celkovému pohodlí a motivaci členů instituce, což je zásadní pro udržení jejich dlouhodobé angažovanosti v organizaci.
Aby byl dosažen maximální dopad onboardingových postupů, je klíčové zajistit, aby byly tyto postupy schváleny a podporovány nadřízenými.
VŠCHT Praha a onboarding
Ve spolupráci s PRIDE network (Professionals in Doctoral Education) vznikla pracovní skupina s cílem sepsat publikaci k onboardingu a zaměřit se vůbec poprvé na doktorandy a postdoky a jejich adaptační proces na univerzitě.
VŠCHT Praha nejprve provedla dotazníkové šetření s cílem zjistit povědomí o samotném onboardingu, zda a kolik lidí se s ním již setkalo a co by uvítali na akademické půdě. Po vyhodnocení dotazníku následovaly schůzky s personalisty z privátního sektoru s cílem ověřit, jak onboarding probíhá v soukromých společnostech a jak může VŠCHT Praha jejich know-how a zkušenosti využít. Sesbírané materiály a rozhovory s HR specialisty posloužily k vytvoření adaptačního plánu, který byl pilotován od září 2023 na celkem třech ústavech VŠCHT Praha. Výsledný adaptační plán, který je součástí této stránky, bude sloužit pro potřeby školitelů a nově nastoupivších doktorandů z VŠCHT Praha a zároveň bude publikován v rámci PRIDE network, aby na něm mohly stavět i další evropské univerzity.
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 75736
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /onboarding_cz
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => stranka
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 1
)
)
[51210] => stdClass Object
(
[nazev] => Zájemci o doktorské studium
[seo_title] => Zájemci o doktorské studium
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] =>
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[iduzel] => 51210
[canonical_url] => //phd.vscht.cz/zajemci-o-phd
[skupina_www] => Array
(
)
[url] => /zajemci-o-phd
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => boxy
[html] =>
[css] =>
[js] => $(function() {
setInterval(function () { $('*[data-countdown]').each(function() { CountDownIt('#'+$(this).attr("id")); }); },1000);
setInterval(function () { $('.homebox_slider:not(.stop)').each(function () { slide($(this),true); }); },5000);
});
function CountDownIt(selector) {
var el=$(selector);foo = new Date;
var unixtime = el.attr('data-countdown')*1-parseInt(foo.getTime() / 1000); if(unixtime<0) unixtime=0;
var dnu = 1*parseInt(unixtime / (3600*24)); unixtime=unixtime-(dnu*(3600*24));
var hodin = 1*parseInt(unixtime / (3600)); unixtime=unixtime-(hodin*(3600));
var minut = 1*parseInt(unixtime / (60)); unixtime=unixtime-(minut*(60));
if(unixtime<10) {unixtime='0'+unixtime;}
if(dnu<10) {unixtime='0'+dnu;}
if(hodin<10) {unixtime='0'+hodin;}
if(minut<10) {unixtime='0'+minut;}
el.html(dnu+':'+hodin+':'+minut+':'+unixtime);
}
function slide(el,vlevo) {
if(el.length<1) return false; var leva=el.find('.content').position().left; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1;
var cislo=leva/sirka*-1; if(vlevo) { if(cislo+1>pocet) cislo=0; else cislo++; } else { if(cislo==0) cislo=pocet-1; else cislo--; }
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
function slideTo(el,cislo) {
if(el.length<1) return false; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; if(cislo<0 || cislo>pocet) return false;
el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka});
el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected');
el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected');
return false;
}
[autonomni] => 1
)
)
[50300] => stdClass Object
(
[nazev] => PhD Double Degree (DD)
[seo_title] => PhD Double Degree (DD)
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[perex] => 
[ikona] =>
[obrazek] => 0002~~y0lMyi9KLMkvik9KTEs0MQYA.jpg
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[obsah] => VŠCHT Praha spolupracuje s partnerskými univerzitami v Evropě a nabízí společné doktorské studijní programy.
Double-Degree programy
Double degree programy jsou akreditované prezenční studijní programy probíhající od počátku na dvou partnerských univerzitách.
Studenti doktorského studia mají v rámci tohoto studia možnost vypracovat jednu disertační práci pod vedením školitelů z obou vysokých škol a získat diplomy obou institucí. Podmínkou pro udělení diplomů oběma institucemi je splnění studijních povinností předepsaných oběma partnerskými univerzitami v individuálním studijním plánu a úspěšná obhajoba dizertační práce před společnou komisí. Část disertační práce je vypracována během pobytu na zahraniční vysoké škole.
Nabízené double degree programy
V současnosti je na VŠCHT Praha akreditovaných 8 doktorských programů na 4 fakultách. Všechny programy jsou akreditované v českém i anglickém jazyce.
FCHT
FTOP
FPBT
FCHI
Kontakty na VŠCHT Praha
Otázky k možnostem studia v akreditovaných double degree programech směřujte na kontaktní osoba u daného Double degree programu.
O záměru studovat Double Degree program informujte Mili Losmanovou z Oddělení pro výzkum a transfer technologií, která má Double degree na starosti.
Finance
Na pokrytí zvýšených nákladů spojených se studiem Double Degree programu je možné čerpat finanční podporu z mobilitních programů Zahraničního oddělení. Studium realizované ve spolupráci s univerzitami ve Francii je podporováno z Barrande Fellowhip Programme a v případě Spolkové republiky Německo pak z DAAD, nebo Bayhost.
Jaké jsou výhody
Kromě zvýšení atraktivity na trhu práce pro absolventy programu je v programu kladen důraz na výzkumnou činnost s možností vedení menších vědeckých skupin. Dochází ke zkvalitnění odborných jazykových znalostí a nabízí se zajímavé možnosti získání praxe – jsou zajištěny stáže u spolupracujících firem (např. Zentiva, Zeva, Contipro či Lonza Biotec), nebo odborně zaměřených ústavech AV ČR. V neposlední řadě pak program přináší podporu studentů včetně motivačních stipendií.
[urlnadstranka] => [iduzel] => 50300 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /phd-double-degree [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [51209] => stdClass Object ( [nazev] => Je třeba se přihlásit [seo_title] => Je třeba se přihlásit [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => zamek [obrazek] => [obsah] =>Tato stránka je určena pouze pro akademickou obec VŠCHT Praha.
Pro přístup je třeba se přihlásit svým účtem do sítě VŠCHT Praha v pravém horním rohu na tomto webu.
Pokud se nemůžete přihlásit nebo si myslíte, že vidíte tuto stránku v důsledku chyby, ozvěte se na webmaster@vscht.cz.
[urlnadstranka] => [iduzel] => 51209 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error403] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_ikona [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [1485] => stdClass Object ( [nazev] => Stránka nenalezena [seo_title] => Stránka nenalezena (chyba 404) [seo_desc] => Chyba 404 [autor] => [autor_email] => [obsah] =>Chyba 404
Požadovaná stránka se na webu (již) nenachází. Kontaktuje prosím webmastera a upozorněte jej na chybu.
Pokud jste změnili jazyk stránek, je možné, že požadovaná stránka v překladu neexistuje. Pro pokračování prosím klikněte na home.
Děkujeme!
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 1485 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error404] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 51163 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => dokumenty [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => web [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )DATA
stdClass Object
(
[nazev] =>
[seo_title] => Detail programu
[seo_desc] =>
[autor] =>
[autor_email] =>
[obsah] =>
[submenuno] =>
[urlnadstranka] =>
[ogobrazek] =>
[pozadi] =>
[newurl_domain] => 'phd.vscht.cz'
[newurl_jazyk] => 'cs'
[newurl_akce] => '/home/pro-doktorandy/nabidka-predmetu/program/22310/AD104'
[newurl_iduzel] =>
[newurl_path] => 1/50375/50376/51163/51164/17704/65652/65654
[newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
[iduzel] => 65654
[platne_od] => 25.08.2022 15:42:18.330754
[zmeneno_cas] => 25.08.2022 15:42:18.333282
[zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
[canonical_url] => _clone_
[idvazba] => 78753
[cms_time] => 1715169762
[skupina_www] => Array
(
)
[slovnik] => Array
(
)
[poduzel] => stdClass Object
(
[65655] => stdClass Object
(
[nadpis] =>
[apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/program?weburl=/home/pro-doktorandy/nabidka-predmetu
[urlwildcard] => cis-path
[poduzel] => Array
(
)
[api_suffix] => 22310/AD104
[iduzel] => 65655
[canonical_url] =>
[skupina_www] => Array
(
)
[url] =>
[sablona] => stdClass Object
(
[class] => api_html
[html] =>
[css] =>
[js] =>
[autonomni] => 0
)
[html] =>
|
Bioinformatics
Doktorský program,
Fakulta chemické technologie
The aim of the DSP programme is to educate specialists in bioinformatics, which is a combination of molecular and cell biology, biochemistry, statistics and computer science. Bioinformatics deals with the development of tools for the management of biological databases, algorithms for the processing of molecular-biological data and methods for the analysis and interpretation of relationships in these data. Most of the projects are biologically oriented with the aim to understand the complex context in the studied biological phenomena. However, we also run IT-oriented topics that include the development of algorithms or data processing methods. UplatněníThe combination of the education in natural sciences and informatics qualifies graduates to work in interdisciplinary teams. Graduates will find employment in a wide range of areas where data obtained by instrumental analysis of biological samples are processed. Graduates can also rely on a broad knowledge of informatics and can be successful in the development of software technologies, especially for data analytics. Graduates will further find employment in scientific infrastructures built in the Czech Republic within the framework of European operational programs. Due to the persisting lack of experts with an interdisciplinary education, graduates will also be easily employable outside the Czech Republic. Typical positions that DSP Bioinformatics graduate can hold: - researcher in basic or applied research in the public or private sector in the fields of biomedicine, clinical medicine, medical and pharmaceutical chemistry, food, agriculture, biotechnology or forensic science. Typical positions are postdoc, programmer, research associate, research fellow, project leader, project manager. - university lecturer in bioinformatics, computational biology, computational chemistry or applied informatics. Typical positions are assistant professor, assistant, lecturer. - software developer or data analyst in IT companies. - professional positions that require organizational and analytical skills and expertise not only in bioinformatics. Typical job positions include state administration at the highest management levels, organizations that are methodologically and organizationally engaged in science and research or non-profit and educational organizations. Detaily programu
Vypsané disertační práce pro rok 2021/22Biologické strojové učení
AnotaceNaše laboratoř kombinuje špičkové experimentální (např. LC-MS, metabolomika, RNA-seq) a výpočetní (např. Bioinformatika, molekulární sítě, strojové učení) přístupy k vývoji rychlých, obecně použitelných pracovních postupů pro objevování a využívání bioaktivních molekul odvozených z rostlin. Hledáme talentované a motivované výpočetní výzkumníky, kteří by se připojili k našemu týmu. Úspěšným kandidátem na tuto pozici bude vývoj modelů pro predikci enzymatických aktivit enzymů v biosyntetických drahách. Vzhledem k interdisciplinární povaze laboratoře bude tento projekt prováděn v úzké spolupráci s experimentálními výzkumníky, kteří budou generovat data pro trénink a ověřování modelu.
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha
Celogenomové mapování míst tvorby genotoxických meziproduktů vznikajících při kolizích replikačních a transkripčních komplexů
AnotaceBylo zjištěno, že aktivované onkogeny v lidských přednádorových lézích způsobují zastavení a kolaps replikačních vidlic, což vede ke genetické nestabilitě a vývoji rakoviny. Navrhovaný projekt ověřuje hypotézu, že replikační stres vyvolaný aktivací onkogenů je důsledkem interference mezi transkripcí a replikací způsobující tvorbu RNA:DNA hybridů, které mají genotoxické účinky. Náplní projektu je za spolupráce biologů s bioinformatiky: (i) identifikovat místa v genomu, kde se tvoří R-smyčky v podmínkách onkogeny indukovaného replikačního stresu; (ii) určit základní charakteristiky těchto míst; (iii) zjistit, zda aktivace onkogenů je spojena s tvorbou RNA:DNA hybridů ve fragilních úsecích chromosomů, jenž preferenčně vykazují nestabilitu za těchto podmínek; (iv) zjistit, zda se místa tvorby R-smyček překrývají s místy genomových translokací a deleci detekovaných ve zhoubných nádorech.
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha
Genetická rekombinace a reprodukční izolace na modelu Mus musculus
AnotaceCílem navrhovaného dizertačního projektu je objasnit epistatické interakce PRDM9 histon metyltransferázy s X-vázaným genetickým faktorem Hstx2 v meiotické rekombinaci a samčí neplodnosti mezi-poddruhových hybridů. Naše laboratoř identifikovala Prdm9 jako první gen obratlovců, který se účastní reprodukční izolace mezi druhy. PRDM9 protein predeterminuje meiotické rekombinační hotspoty uvnitř druhu k zajštění crossing-overů, chromozomálního párování a diferenciace pohlavních buněk, ale u mezdruhových hybridů tentýž gen zapřičiňuje meiotickou zástavu a hybridní sterilitu prostřednicvím persistence DNA dvojřetězcových zlomů, poruchy rekombinace a následnou poruchou párování chromozomů. Proces je modulován Hstx2 genetickým faktorem lokalizovaným v 2.7 Mb intervalu chromozomu X. Hlavním úkolem projektu je identifikovat genomickou sekvenci odpovědnou za Hstx2 efekt s použitím panelu bioinformatických nástrojů pro mRNA expresní profilování pomocí Next generation RNA sequencing (RNA-seq), pro sekvenaci imunoprecipitovaného chromatinu (ChIP-seq) a pro mapování lokusů kvantitativních znaků (QTL).
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha
Výpočetní hmotnostní spektrometrie
AnotaceNaše laboratoř kombinuje špičkové experimentální (např. LC-MS, metabolomika, RNA-seq) a výpočetní (např. Bioinformatika, molekulární sítě, strojové učení) přístupy k vývoji rychlých, obecně použitelných pracovních postupů pro objevování a využívání bioaktivních molekul odvozených z rostlin. Hledáme talentované a motivované výpočetní výzkumníky, kteří by se připojili k našemu týmu. Úspěšným kandidátem na tuto pozici bude vývoj nové generace platformy MZmine (https://mzmine.github.io) pro zpracování dat hmotnostní spektrometrie v metabolomice. Mimo jiné se snažíme přidat k MZmine plnou podporu pro iontovou pohyblivou spektroskopii (IMS) a zlepšit její schopnosti molekulárních sítí. Doporučují se zkušenosti s programováním v Javě.
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha
|