Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Bioinformatika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Edward A. Curtis, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Deoxyribozymy, DNA molekuly katalyzující chemické reakce, jsou užitečnými nástroji díky nízké ceně, vysoké stabilitě a schopnosti fungovat ve velkém spektru podmínek. Cílem této práce bude vyvinout nové metody analýzy velkých datasetů deoxyribozymů isolovaných v naší laboratoři pomocí NGS (Next Generation Sequencing). Projekt bude vyžadovat znalost standardních bioinformatických postupů, ale i čím dál tím populárnějších metod strojového učení.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	RNDr. Irena G. Stará, CSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílem projektu je vyvinout přípravu nových deformovaných a chirálních nanouhlíkových systémů, jakými jsou helikální pi-konjugované makrocykly nebo cykloareny. Chirální látky budou připraveny v opticky čisté formě skrze resoluci racemátů či pomocí asymetrické syntézy. Budou studovány jejich (chir)optické vlastnosti, samoskladba v 2D/3D prostoru, aromatický charakter a jejich konformační či redoxní chování s cílem identifikovat jejich možné aplikace v chemii či nanovědě.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	prof. Ing. Michal Hocek, DSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Tématem disertace bude design a enzymová syntéza hypermodifikovaných xeno-nukleových kyselin s kombinací modifikací na bázi, cukerné části a fosfátových spojkách. Po optimalizaci metodiky budou připravovány a testovány hypermodifikované XNA oligonukleotidy jako potenciální terapeutika.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	RNDr. Ivo Starý, CSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

V rámci doktorského projektu bude vyvíjena nová třída helikálně chirálních kovových komplexů určených pro enantioselektivní katalýzu. Hlavní část práce se bude věnovat návrhu jejich designu a syntéze. Katalytický potenciál připravených systémů bude následně ověřen na modelových enantioselektivních transformacích katalyzovaných tranzitními kovy, zejména na cykloisomerizaci alkynů, (foto)redoxních a aktivačních procesech.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	RNDr. Tomáš Slanina, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Multiplicita excitovaných stavů hraje klíčovou roli při řízení fotochemické reaktivity. Excitované organické molekuly se nejčastěji vyskytují v singletovém nebo tripletovém excitovaném stavu. Singletové stavy mívají typicky krátkou dobu života (řádově ns) a často vykazují výrazný zwitteriontový charakter. Naproti tomu tripletové excitované stavy mají díky své diradikálové povaze podstatně delší dobu života (řádově ?s až ms), což umožňuje i difuzně řízené intermolekulární procesy. Rozdílné fotochemické chování singletů a tripletů bylo dosud většinou interpretováno fenomenologicky, přičemž jako hlavní faktory se uvádějí právě jejich doby života a zwitteriontový či diradikálový charakter. Základní příčina tohoto rozdílu — elektronový spin — však při racionalizaci fotochemické reaktivity často zůstává opomíjena. Doktorand(ka) se proto zaměří na návrh a studium multiplicitně řízených fotoreakcí, vycházejících z prvních principů a zohledňujících spin–spinové interakce i spinová výběrová pravidla.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Mgr. Jiří Kaleta, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Disertační práce bude zaměřena na mechanistické principy tzv. photogearingu na molekulární úrovni, tedy na převod světlem řízeného primárního pohybu na mechanicky vázanou sekundární rotaci. Zatímco řada molekulárních systémů vykazuje fotoindukované strukturní změny, pouze omezené množství z nich umožňuje skutečný přenos pohybu analogický makroskopickým ozubeným kolům. Cílem práce je objasnit, jak lze unidirekcionální molekulární motory kombinovat s původně Brownovsky rotujícími jednotkami tak, aby byl jejich pohyb vynuceně korelovaný a směrový. Projekt propojí návrh a syntézu molekul, fotochemická a kinetická měření a detailní mechanistickou analýzu, umožňující rozlišit skutečné mechanické vazby od čistě energetických či allosterických efektů. Výsledky přispějí k formulaci obecných návrhových principů molekulárních fotopřevodů a k hlubšímu porozumění řízení pohybu v umělých molekulárních strojích.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Mgr. Jitka Štáfková, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Terpenoidy představují nejrozmanitější a početně nejbohatší skupinu přírodních látek, které jako sekundární metabolity hrají roli v komunikaci a obraně organismů. Jejich biosyntéza je s ohledem na využití v průmyslu dobře prostudovaná u rostlin a některých mikroorganismů. Mezi živočichy jsou terpenoidy nejvýrazněji zastoupeny u hmyzu, kde ale homologní terpensynthasy obecně nejsou přítomny a kde byl v několika příkladech doložen vznik terpensynthasové aktivity u duplikovaných genů pro isoprenyldifosfátsynthasy. V rámci tohoto doktorského projektu bude student*ka hledat kandidátní sekvence terpensynthas v genomických a transkriptomických datasetech z několika ekonomicky významných druhů hmyzu. Tyto enzymy bude funkčně charakterizovat s použitím různých expresních systémů a hledat u nich strukturní rysy spojené s doloženou enzymatickou aktivitou. Doktorský projekt bude součástí širšího výzkumného záměru podpořeného grantem Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy (INTER COST, 2024-2027).

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:
Dále nabízena v programech:	Chemie ( výuka v českém jazyce ), Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Dr. habil. Ullrich Jahn
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Právě jsme dokončili přístupy ke glycinovým alkoxyaminům, které jsou velkým příslibem v biokonjugaci. V rámci tohoto projektu bude prozkoumán potenciál těchto nepřírodních derivátů aminokyselin pro přístup k novým peptidovým strukturám.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Ing. Zlatko Janeba, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílem projektu je navrhnout, syntetizovat a strukturně optimalizovat (studie SAR) potenciální inhibitory enzymů PRMT5/MAT2. Takové inhibitory vykazují protinádorovou aktivitu u rakovin s delecí/inhibicí enzymu MTAP. Biologické vlastnosti připravených látek budou vyhodnoceny ve spolupráci s dalšími vědeckými skupinami. Klíčová slova: PRMT5/MAT2, inhibitory; syntéza; strukturně-aktivitní studie

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Dr. Paulo Paioti
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Naše skupina nedávno vyvinula metodu nukleofilní aromatické substituce pro syntézu léčivých atropizomerů, chirálních konformačních izomerů vznikajících omezenou rotací jednoduché vazby. V této souvislosti jsme objevili fluoridem katalyzovanou reakci, která je mimořádně účinná. V této doktorské práci budeme dále zkoumat tuto metodu pro syntézu atropizomerů a dalších bioaktivních sloučenin. Primárním cílem je pokrok v oblasti katalytické organické syntézy. Ve spolupráci budeme hodnotit biologickou aktivitu jedinečných molekul syntetizovaných v průběhu projektu.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Molekulární chemická fyzika a senzorika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Mgr. Petr Cígler, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Kvantové nanosenzory přináší oproti klasický senzorům výhodu velké citlivosti a vysokého rozlišení. Jedním typem takového kvantového nanosenzoru jsou fotoluminiscenční nanočástice, jejichž detekce spočívá v sledování změn luminiscence v odpovědi na vnější podněty. Cílem práce bude čtení optických nanosenzorů s využitím pulzní optické elektronové paramagnetické rezonance (EPR) detekce a sledováním spektrálních změn. Student bude navrhovat a implementovat pokročilé pulzní sekvence do stávajícího kvantového konfokálního mikroskopu, provádět a vyhodnocovat měření. Dále bude optimalizovat senzitivitu nanosenzorů pomocí chemických modifikací povrchu. Výstupem práce bude časově-rozlišená lokální kvantová detekce v biologicky relevantním prostředí. Předpokládané znalosti uchazeče na úrovni ukončeného magisterského studia v oboru biofyzika a chemická fyzika nebo fyzikální chemie. Práce bude vypracována v týmu Syntetická nanochemie na ÚOCHB AV ČR.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Molekulární chemická fyzika a senzorika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Lubomír Rulíšek, Ph.D., DSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Oblast přepracování (redesign) stávajících nebo návrhů enzymů nových, často podporovaná výpočetními algoritmy, doznala v posledních několika desetiletích značného rozvoje. V literatuře poslední doby lze najít mnoho úspěšných příkladů. Patří mezi ně záměna jedné aminokyseliny v proteinu za účelem dosažení katalytické aktivity u neaktivního enzymu, přepracování katalytických kofaktorů nebo „chemomimetická“ biokatalýza využívající syntetický potenciál enzymů závislých na kofaktorech. V navrhované práci bude využito efektivní konformační vzorkování založené na strojově-učených kvantově mechanických energiích v implicitním rozpouštědle (ML-QM(DFT)/COSMO energie) pro návrh nových a dosud nepoznaných oligopeptidů, které po vložení kovu budou napodobovat katalytická místa v nativních architekturách v metaloenzymech. Pomocí stejných metod a přístupů budeme také zkoumat stejnou otázku u peptidů složených z xeno- (nepřirozených, či nekanonických) -aminokyselin, abychom odhalili dosud neprobádaný katalytický potenciál metalo-xeno peptidů či jejich proteinových protějšků. Tímto způsobem bychom mohli otevřít nové obzory v biokatalýze, včetně zcela nové oblasti metalo-xeno peptidů.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Ing. Zlatko Janeba, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

5?-Methylthioadenosinová nukleosidáza (MTAN) je uznávaným cílem pro vývoj potenciálních antibakteriálních látek. Inhibitory MTAN proto mohou mít uplatnění v léčbě bakteriálních infekcí. Cílem projektu je návrh, syntéza a strukturní optimalizace (studie vztahů struktury a aktivity, SAR) inhibitorů MTAN. Biologické vlastnosti připravených sloučenin budou hodnoceny ve spolupráci s dalšími výzkumnými skupinami.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. RNDr. Martin Dračínský, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Projekt je zaměřen na studium nekovalentních interakcí v molekulárních systémech pomocí NMR spektroskopie v roztoku i v pevné fázi. Nekovalentní interakce, jako jsou vodíkové vazby a ?–? interakce, hrají klíčovou roli při určování struktury, dynamiky a funkce molekul v chemických a biologických systémech. Porozumění tomu, jak jsou tyto interakce ovlivňovány okolním prostředím, představuje významnou výzvu současné chemie. Část projektu bude věnována studiu vlivu solvatace na geometrii, dynamiku a fyzikálně-chemické vlastnosti biomolekul a molekulárních přepínačů. Molekuly rozpouštědla ovlivňují rozpuštěné látky prostřednictvím specifických intermolekulárních interakcí i nespecifických efektů souvisejících s dielektrickými vlastnostmi prostředí. NMR spektroskopie v roztoku bude použita k získání informací na atomární úrovni o interakcích mezi rozpouštědlem a rozpuštěnou látkou a o jejich vlivu na chování molekul.Projekt se dále zaměří na studium vlivu krystalového balení na vlastnosti molekulárních pevných látek. Pomocí NMR spektroskopie v pevné fázi bude zkoumáno, jak intermolekulární kontakty a motivy balení ovlivňují strukturní uspořádání a molekulární dynamiku v pevné fázi. Experimentální NMR data budou kombinována s kvantově-chemickými výpočty.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:
Dále nabízena v programech:	Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce ), Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Dr. habil. Ullrich Jahn
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Nedávno jsme objevili nové architektury P-chirálních ligandů, které byly úspěšně použity jako ligandy v asymetrické katalýze zlata. Obecně jsou fosfiny zároveň užitečnými organokatalyzátory v řadě reakcí. V rámci tohoto projektu bude prozkoumán potenciál našich P-chirálních fosfinů v asymetrické organokatalýze, jako jsou cykloadice, Michaelovy adice, allylové substituce nebo umpolungové reakce.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Léčiva a biomateriály ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. RNDr. Martin Dračínský, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Tento doktorský projekt se zaměří na studium vlivu chemických modifikací na interakce mezi biomolekulami, zejména na vodíkové vazby. Práce propojí organickou syntézu cíleně upravených biomolekulárních stavebních bloků – například modifikovaných nukleosidů – s pokročilou NMR spektroskopií pro charakterizaci jejich interakcí. Hlavními cíli budou kvantitativní stanovení volných energií vazby a objasnění toho, jak konkrétní strukturální změny modulují sílu a selektivitu vazeb. Klíčovou metodickou součástí bude sledování tautomerních rovnováh a studium toho, jak jsou tyto rovnováhy posouvány mezimolekulovými vodíkovými vazbami, což umožní odvodit termodynamické parametry těchto interakcí. Projekt tak přispěje k hlubšímu pochopení vztahů mezi strukturou a interakcemi v biomolekulárních systémech a poskytne rámec pro racionální návrh biomolekul s upravenými vlastnostmi. Syntetická část projektu bude prováděna pod vedením prof. Andrea Brancale na VŠCHT.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Molekulární chemická fyzika a senzorika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Lubomír Rulíšek, Ph.D., DSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Hlavním cílem je vývoj a implementace ‘ab initio’ prediktoru struktury proteinů (pracovně pojmenovaného QMLFold). QMLFold spojí rozšíření solvatační teorie COSMO-RS do 3D prostoru (označené jako 3D-COSMO-RS) s kvantově-chemickými (QM) potenciály peptidů získaných strojovým učením (které byly nedávno vyvinuty v naší skupině) a efektivními algoritmy vzorkování. Program by měl být nezávislý na existujících proteinových strukturách, a být tedy univerzální a všestranný. Strojové učení v rámci jeho algoritmu – „ML“ v QMLFold – bude použito pouze k predikci intramolekulárních volných energií krátkých peptidových fragmentů tvořících proteinový řetězec (v „QM/DFT kvalitě“). Paradigma, které stojí za QMLFold-em, se dá vyjádřit otázkou, zdali můžeme skládání proteinů považovat za „solvatační problém“. Jinými slovy, zdali můžeme protein považovat za soubor chemicky odlišných entit – postranních řetězců aminokyselin, kovalentně spojených „poly-glycinovou“ páteří, které jsou rozpuštěny samy v sobě? QMLFold může otevřít nové obzory v biokatalýze, designu peptidů vázajících kovy (senzorů) a může být potenciálním průlomem v oblasti, která není přístupná algoritmům typu AlphaFold3 (tedy oblasti středně velkých peptidů, nestrukturovaných proteinů či peptidů s xeno-aminokyselinami).

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Molekulární chemická fyzika a senzorika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Mgr. Petr Cígler, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Fotoluminiscenční nanodiamanty jsou novým typem kvantových biosenzorů využívajících změnu luminiscenčních vlastností v odpovědi na vnější podněty. Oproti klasický senzorům přinášejí výhodu velké citlivosti a vysokého rozlišení, ale jsou často nespecifické. Cílem práce bude chemická funkcionalizace těchto senzorů za účelem specifické a citlivé detekce v biologicky relevantním prostředí. K tomu student využije kovalentní modifikace povrchu nanosenzorů v koloidním stavu a provede jejich následnou charakterizaci. Funkčnost takto zkonstruovaného nanosenzoru ověří pomocí kvantového konfokálního mikroskopu s využitím pokročilých pulzních sekvencí. Výstupem práce bude časově-rozlišená lokální kvantová detekce specifických molekul. Předpokládané znalosti uchazeče na úrovni ukončeného magisterského studia v oboru biofyzika, chemická fyzika nebo fyzikální chemie. Práce bude vypracována v týmu Syntetická nanochemie na ÚOCHB AV ČR.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:
Dále nabízena v programech:	Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce ), Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Ing. Milan Vrábel, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílem projektu je navrhnout a syntetizovat různé heterodieny, jako jsou tetraziny a triaziové soli, a studovat jejich reaktivitu s neaktivovanými a napjetými dienofily. Bude zkoumán vliv různých substituentů na reakční kinetiku a potenciál sloučenin pro fluorogenní značení. Nejslibnější sloučeniny budou testováni na modelových biologických systémech, včetně proteinů (nebo jiných biomolekul) a buněčných kultur.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	prof. Ing. Michal Hocek, DSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Tématem disertace bude enzymová syntéza hypermodifikovaných xeno-nukleových kyselin a jejich využití v selekci aptamerů. Bude nutno vyvinout enzymovou syntézu modifikovaných XNA knihoven, selekci vazebných sekvencí, reverzní transkripci do DNA a sekvenaci. Cílem bude vývoj stabilních aptamerů vážících cílové molekuly (biomarkery, proteiny apod.).

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:
Dále nabízena v programech:	Chemie ( výuka v českém jazyce ), Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Dr. Emanuela Jahn
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Účinná a univerzální syntéza struktur bohatých na dusík vyžaduje neustálý vývoj, vzhledem k jejich významu pro medicínskou chemii a chemickou biologii. V tomto projektu zkoumáme syntetickou využitelnost stabilních N-heterocyklických radikálů s cílem objevit nový chemický prostor. Farmakologický profil syntetizovaných molekul bude hodnocen pomocí patch-clamp elektrofyziologie vápníkových iontových kanálů s cílem vyvinout nové molekuly s analgetickými vlastnostmi.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	RNDr. Ivo Starý, CSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílem projektu je příprava nových helikálních TADF a excimerových luminoforů odvozených od helicenů a studovat jejich chiroptické vlastnosti v roztoku a tenkých vrstvách (zejména cirkulárně polarizovanou luminiscenci) za účelem identifikace vhodných materiálů pro budoucí konstrukci CP-OLED.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	prof. Ing. Michal Hocek, DSc.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílem práce bude syntetizovat PROTACy pro několik kináz, které jsou validovanými targety v onkologii a poruchách CNS. Zaměří se na optimalizaci linkerů, výběr ligandů ligáz a specificitu pro cílovou kinázu. Jako výchozí bod poslouží naše nedávno vyvinuté vysoce selektivní nízkomolekulární heterocyklické inhibitory kinas.

Místo výkonu práce:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Garantující pracoviště:	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Molekulární chemická fyzika a senzorika ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Doc. Mgr. Michal Straka, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Cílená radioterapie založená na komplexech kovových radionuklidů představuje významný směr vývoje moderní onkologické léčby. Klíčovou roli v těchto systémech hrají chelátory, které musí zajistit vysokou termodynamickou stabilitu komplexu, kinetickou inertnost v biologickém prostředí a vhodnou koordinační geometrii kovového centra. Tato práce se zaměřuje na výpočetní návrh a charakterizaci chelátorů založených na peptidových ligandech nebo od peptidů odvozených chelátorů pro komplexaci terapeuticky relevantních radionuklidů, zejména 177Lu, 161Tb, 225Ac a případných dalších. Pomocí kvantově-chemických výpočtů (DFT) budou studovány geometrie, vazebné energie a elektronové vlastnosti komplexů, rovněž pak specifita vazby jednotlivých iontů radionuklidů uvedených výše. Součástí práce bude také interpretace experimentálních dat paramagnetické NMR spektroskopie pomocí výpočtů NMR parametrů, umožňující detailní popis struktury a dynamiky paramagnetických komplexů v roztoku. Výsledky budou diskutovány v kontextu vztahů mezi strukturou a vlastnostmi relevantních pro racionální návrh radiofarmakologických ligandů. Praktická realizace bude provedena našimi zahraničními spolupracovníky.