Ústav biotechnologie

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. Ing. Irena Jarošová, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Disertační práce bude zaměřena na dlouhodobý výzkum a vývoj funkčních nealkoholických fermentovaných nápojů se zvýšeným obsahem biologicky aktivních látek, zejména antioxidantů a kyseliny γ-aminomáselné (GABA), s důrazem na jejich technologickou, chemickou a biologickou stabilitu. Výzkum bude probíhat v několika navazujících etapách zahrnujících výběr vhodných surovin rostlinného původu, selekci a charakterizaci mikroorganismů schopných efektivní fermentace a produkce GABA, a optimalizaci fermentačních podmínek s cílem maximalizace funkčních vlastností výsledných nápojů.

Součástí práce bude detailní analytická charakterizace složení nápojů, se zaměřením na obsah polyfenolů, antioxidační aktivitu, tvorbu GABA, senzorické vlastnosti a mikrobiální bezpečnost. V průběhu výzkumu bude rovněž hodnocen vliv technologických zásahů na stabilitu bioaktivních látek během skladování. Výsledky práce mají potenciál přispět k rozvoji inovativních nealkoholických fermentovaných nápojů odpovídajících současným trendům funkční výživy a udržitelné potravinářské výroby.

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. Ing. Petr Kaštánek, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Kombinovaná
Předpokládaný způsob financování:	Pracovní poměr možný

Anotace

Disertační práce je zaměřena na studium biotechnologického potenciálu hub rodu Trichoderma s důrazem na řízenou produkci biologicky aktivních metabolitů v různých typech fermentačních systémů. Pozornost je věnována vztahu mezi kultivačními podmínkami, růstovou dynamikou a kvalitativním i kvantitativním profilem sekundárních metabolitů s antifungálním a stimulačním účinkem. Získané poznatky vytvoří experimentální a technologický základ pro vývoj biologických přípravků určených k ochraně plodin proti půdním fytopatogenům.

Práce reaguje na aktuální společenskou a legislativní poptávku po snižování spotřeby syntetických fungicidů v souvislosti s evropskými strategiemi EU Green Deal a Farm to Fork a na narůstající problém rezistence fytopatogenů vůči konvenčním přípravkům. Houby rodu Trichoderma, jako etablovaná biokontrolní agens s mykoparazitickým, antibakteriálním a indukčně-rezistentním účinkem, představují perspektivní a udržitelnou alternativu k chemickým fungicidům v ekologickém a integrovaném zemědělství.

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i. Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Ing. Mária Zedníková, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Kombinovaná
Předpokládaný způsob financování:	Pracovní poměr možný

Anotace

Mikrobubliny jsou malé bublinky plynu (rozměry cca. 1-1000 mikronů) rozptýlené v kapalině. V mnoha ohledech vykazují odlišné chování od 'běžných' bublin o velikosti milimetrů a centimetrů, s nimiž pracuje většina vícefázových zařízení (kontaktory, reaktory). Mají nízkou stoupavou rychlost a tím velkou dobu prodlení, což zlepšuje transportní a reakční děje a snižuje plýtvání (veškerý plyn rozpustí). Mají velký měrný povrch (m²)/(m³) při daném objemu plynu v zařízení. Využívají se stále častěji v různých aplikacích, ale jejich chování v komplexních průmyslových podmínkách není dostatečně probádáno. V této disertační práci se student seznámí se základními dovednostmi práce s mikrobublinami jako jsou jejich příprava pomocí mikrobublinných generátorů a charakterizace jejich základních vlastností. Potom vyřeší zadaný projekt jejich konkrétního využití v procesu či aplikaci v biotechnologiích. Příkladem je využití mikrobublin při kultivaci mikrořas s efektivní distribucí CO₂, nebo při likvidaci biofilmů pomocí kombinace chemického a hydromechanického účinku mikrobublin.

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. Ing. Barbora Branská, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Tato práce je zaměřena na studium modulačních účinků bioaktivních látek na fyziologii bakterií rodu Clostridium. Cílem je sledovat, jak různé molekuly přírodního původu ovlivňují růstové charakteristiky, viabilitu, schopnost sporulace a germinace, ale také širší fyziologické procesy, včetně metabolických drah, energetického hospodaření, redoxní rovnováhy, změn souvisejících s transportními mechanismy a strukturou buněčných obalů. Součástí práce bude rovněž analýza změn na úrovni genové exprese. Hlavní pozornost bude věnována sekundárním metabolitům houby Monascus, především jejím pigmentům, které představují rozmanitou skupinu biologicky aktivních molekul. V případě prokázané relevance budou do analýzy zahrnuty i další slibné látky a mikrobiální metabolity. Cílem práce je přispět k hlubšímu pochopení interakcí mezi vybranými přírodními látkami a fyziologií klostridií.

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	prof. Dr. Ing. Petra Patáková
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Monascus pilosus je méně známým druhem houby rodu Monascus, který je známý především jako producent monakolinu K. Podstatou práce však bude studium biosyntézy polyketidových pigmentů u tohoto druhu a možnost ovlivnění produkce nejen kultivačními podmínkami (složení kultivačního média, typ kultivace), ale i dalšími zásahy (náhodná mutageneze, přídavek epigenetických regulátorů). Produkce pigmentů bude hodnocena nejen pomocí chromatografických technik, ale také pomocí RT-qPCR metody. Součástí práce bude separace nejhojněji tvořených pigmentů (např. monascuspiloin) pomocí kombinace extrakce různými rozpouštědly a sorpce/eluce ve vhodných materiálech. Izolované pigmenty budou využity pro testování antimikrobiálních vlastností. Při práci bude také zhodnocen potenciál potravinářského využití tohoto druhu, netvořícího mykotoxin citrinin (příprava fermentovaných potravin, využití produkce enzymů a pigmentů v potravinářství).

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnology ( výuka v anglickém jazyce )
Školitel:	prof. Dr. Ing. Petra Patáková
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Monascus pilosus je méně známým druhem houby rodu Monascus, který je známý především jako producent monakolinu K. Podstatou práce však bude studium biosyntézy polyketidových pigmentů u tohoto druhu a možnost ovlivnění produkce nejen kultivačními podmínkami (složení kultivačního média, typ kultivace), ale i dalšími zásahy (náhodná mutageneze, přídavek epigenetických regulátorů). Produkce pigmentů bude hodnocena nejen pomocí chromatografických technik, ale také pomocí RT-qPCR metody. Součástí práce bude separace nejhojněji tvořených pigmentů (např. monascuspiloin) pomocí kombinace extrakce různými rozpouštědly a sorpce/eluce ve vhodných materiálech. Izolované pigmenty budou využity pro testování antimikrobiálních vlastností. Při práci bude také zhodnocen potenciál potravinářského využití tohoto druhu, netvořícího mykotoxin citrinin (příprava fermentovaných potravin, využití produkce enzymů a pigmentů v potravinářství).

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	doc. Ing. Irena Jarošová, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Prezenční
Předpokládaný způsob financování:	Stipendium + mzda

Anotace

Disertační práce bude zaměřena na studium účinnosti netermálního plazmatu (NTP) v kombinaci s vybranými rostlinnými extrakty a antimikrobiálními látkami (antibiotika, antifungální přípravky) při eradikaci mikrobiálních biofilmů. Biofilmy představují významný problém v medicíně, potravinářství i zemědělství, zejména z důvodu zvýšené rezistence mikroorganismů vůči konvenčním metodám dekontaminace.

Práce se bude zabývat hodnocením synergického či aditivního účinku jednotlivých složek v dvoj- a trojkombinacích, optimalizací aplikačních podmínek a studiem možných mechanismů antimikrobiálního působení na modelové bakteriální a kvasinkové biofilmy. K hodnocení účinnosti budou využity mikrobiologické, molekulárně-biologické a zobrazovací metody. Výsledky práce mohou přispět k vývoji nových, účinných a environmentálně šetrných strategií pro kontrolu a eliminaci biofilmů v různých aplikačních oblastech.

Místo výkonu práce:	Ústav biotechnologie, FPBT, VŠCHT Praha
Garantující pracoviště:	Ústav biotechnologie
Studijní program/specializace:	Biotechnologie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	prof. Ing. Tomáš Brányik, Ph.D.
Předpokládaná forma studia:	Kombinovaná
Předpokládaný způsob financování:	Nefinancováno

Anotace

Současný stav poznání v oblasti nealkoholického piva se v posledních letech výrazně rozšířil v důsledku rostoucího zájmu spotřebitelů o zdravější životní styl, alternativy k alkoholickým nápojům a celkový trend inovací v pivovarnictví. Nabídka i spotřeba nealkoholického piva se neustále zvyšuje. Dizertační práce se zaměří na vývoj nových kvasinkových kmenů a jejich následnou aplikaci v podmínkách středních pivovarů a minipivovarů, které z pravidla nedisponují technologiemi potřebnými k odstranění alkoholu z piva. Nové kvasinkové kmeny budou získávány prostřednictvím hybridizačních technik. Cílem práce je vyvinout soubor unikátních hybridních kvasinek určených pro výrobu nealkoholických a nízkoalkoholických piv se senzorickým charakterem piv svrchně a spodně kvašených. Klíčovým milníkem práce je vytvoření primárního souboru technologicky charakterizovaných kvasinkových preparátů, z něhož bude následně selektován redukovaný soubor hybridních kvasinek vhodných pro výrobu nealkoholických či nízkoalkoholických piv s požadovaným senzorickým profilem, dobrou sedimentační schopností a definovaným POF fenotypem. Výzkum vznikne ve spolupráci s EPS biotechnology, s.r.o a VÚPS a.s. s důrazem na praktickou využitelnost.