|
Biotechnology
Doktorský program,
Fakulta potravinářské a biochemické technologie
The purpose of the study programme is to train specialists in biotechnology and other related fields. The study focuses on scientific research and its applications in the development of new products and technologies using the biological agent as the basis of the process. Special attention is paid to the specific properties of microbial, plant, and animal cells and to the acquisition of the ability to apply this knowledge in the development of new products. An integral part is the development of new technical (engineering) solutions to biotechnological processes. The study is therefore focused on a comprehensive studying of theoretical knowledge in chemical, biological, engineering and economic sciences, and on gaining practical experience and skills in the field of management and methodology of biotechnological research. Graduates of this program can participate in basic and applied research at academic institutions and universities, but they can also participate in practice in the Czech Republic and abroad. UplatněníThe graduates of the doctoral study programme Biotechnology are engaged in scientific research focused primarily on the development and optimization of processes for the production of pharmaceutical products, pure chemicals, biofuels, as well as traditional fermentation products. Other applications are directly in the biotechnology industry and related areas of the food, pharmaceutical and chemical industries, including in the area of bio-waste processing and environmental protection. They can hold managerial positions in development, production, control and design in commercial institutions and state administration bodies. Due to the wide concept of expertise they are prepared not only for professional work in their specialization, but also for easy adaptation to possible work in other technological and natural sciences fields. This DSP fully reflects employers' requirements for university graduates, including language skills. Employers prefer broad, interdisciplinary professional skills for future employees as well as key competencies - so-called “soft knowledge and skills”. Detaily programu
Vypsané disertační práce pro rok 2025/26Enzymatická degradace bakteriálních signálních molekul prostřednictvím Ntn-hydroláz jako nový přístup antimikrobiálních terapií
AnotaceRostoucí antibiotická rezistence vyústí globálně v roce 2050 k 10 milionům úmrtí ročně. Cílený návrh quorum-quenching (QQ) enzymů, negativně ovlivňující komunikační proces u gram-negativních bakterií vedoucí k tvorbě biofilmu, tzv. quorum sensing (QS) proces, představuje chytrou strategii, jak s touto hrozbou účinně bojovat. Konstrukce a příprava modifikovaných proteinů ze skupiny Ntn-hydroláz (např. ecPGA izolovaných z Escherichia coli) pomocí geneticky-molekulárních technik (RF cloning, PCR-based methods, CRISPR/Cas technology) a biotechnologických strategií (scale up proces, His tag purifikace) povede k vytvoření unikátního QQ enzymu s požadovanými vlastnostmi pro specifickou vazbu k širšímu spektru HSL molekul (3-oxo-C12-HSL, C8-HSL, C6-HSL, C4-HSL). Navržené modifikované enzymy budou použity v in vitro interakcích s vybranými HSL molekulami a bude sledována jejich degradační aktivita. Degradační účinnost bude dále testována v biologickém modelu při vývoji a maturaci biofilmu u významných HSL-dependentních gram-negativních patogenů Pseudomonas aerugonosa, Klebsiella pneumoniae and Aeromonas veronii. Morfologie biofilmu bude analyzována pomocí elektronové mikroskopie, zatímco profil signálních molekul syntetizovaných v bakteriální populaci bude důkladně prozkoumán pomocí kapalinové chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Projekt prozkoumá a zvýší biotechnologický potenciál těchto QQ enzymů působit jako alternativa a doplněk ke konvenčním antibiotickým terapiím a činidlům pro lékařské a průmyslové využití v boji proti tvorbě biofilmu.
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Změny močového mikrobiomu a metabolomu v odpovědi na léčebnou intervenci u pacientek se symptomy hyperaktivního močového měchýře
AnotaceVýznamné pokroky v oblasti výzkumu lidského mikrobiomu vedly k objevu osídlení močových cest mikroorganismy. V současnosti bylo v moči identifikováno více než 500 bakteriálních druhů, což naznačuje významnou diverzitu mikrobiomu močového systému. V souvislosti s nárůstem znalostí o močovém mikrobiomu roste evidence signifikantních rozdílů ve složení mikrobiomu u zdravých jedinců a jedinců se strukturálním, případně funkčním onemocněním dolních močových cest. Hyperaktivní močový měchýř (OAB) je chronické onemocnění dysfunkce dolních močových cest postihující až 20 % populace, častěji ženy než muže, charakterizované náhlými a obtížně potlačitelnými urgencemi a urgentní inkontinencí s negativním dopadem na kvalitu života. Patofyziologie OAB je multifaktoriální, zahrnující poruchy nervové inervace, urotelové funkce, metabolický syndrom a další faktory. Standardní léčba OAB je většinou založená na změně životního stylu, behaviorální terapii a farmakoterapii, přičemž anticholinergika jsou považovány za hlavní terapeutické možnosti. Cílem této studie je korelace charakteristik močového mikrobiomu a metabolomu se závažností symptomů OAB a vyhodnocení změn močového mikrobiomu a metabolomu v odpovědi na léčebnou intervenci OAB. Do studie bude zařazeno 210 subjektů, z toho cca 60 se symptomy OAB a 150 zdravých kontrol. Kritériem pro zařazení do skupiny OAB bude přítomnost klinických obtíží, a jejich objektivní kvantifikace pomocí skore dorazníku OAB-V8 a hladina hostitelského nervového růstového faktoru (NGF), který je považován za jeden z laboratorních markerů OAB. Pro analýzu mikrobiomu budou použity standardní molekulární techniky izolace a purifikace DNA, amplifikace pomocí PCR a sekvenace metodou masivního paralelního sekvenování na platformě Illumina MiSeq doplněnou bioinformatickou analýzou. Vedle mikrobiálního zastoupení budou klíčovým spojením s daným stavem i molekulární mechanismy na úrovni identifikace specifických nízkomolekulárních metabolitů. Necílenou metabolomikou přistoupíme ke komplexnímu profilování molekul a semikvantitativně stanovíme hladiny unikátních metabolitů. Poskytneme tak nové poznatky o biochemických funkcích detekovaných metabolitů spojených s OAB a identifikujeme případně vhodné biomarkery spojené s vývojem tohoto onemocnění.
kontaktujte vedoucího práce
Místo výkonu práce:
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
|
Nacházíte se: VŠCHT → Web PhD → Doktorské studium na VŠCHT Praha → Současní doktorandi → Nabídka předmětů doktorského studia → Detail programu
Aktualizováno: 25.8.2022 15:42, Autor: Jan Kříž